毒理学是研究分析无机有机化学、电磁学和怪物中药制剂对怪我们身体的有损使用的学科教学。维护毒理学测试方法针对于开发设计安全的的医药、小型农机无机有机化工品和生产物料，并且 确保和维护环保表露对稳定的未知引响是必需的。毒素DNA组学侧量里面和身体之外的分子结构變化，以理解和预计毒素对稳定的有不良引响引响。据预计，毒素DNA组学将根据满足更早、更最准确的毒理学预计和从绿色模形到我们的外推，最后修改不良后果自动识别和风险性分析，并且 齐全修改毒理学。 202历经四年5月2日，菲律宾渥太华学校生态学系Carole L. Yauk 团队图片在Nature Reviews Genetics（IF=39.1）上线刊出了题写“Progress in toxicogenomics to protect human health”，经典文章强调近期转录组学工作平台的高通骁龙量基本特征不使在一些工作中能能估评数个含量、时点和产物。虽然，所有能力表观遗传组方法，如血清质组学、细胞代谢组学和表观表观遗传组学，特别越部分地区归入渗透性表观遗传组学探究，为渗透性机理展示了补充维生素书证（图1）。

毒素促进的转录组谱被中用识别系统聚集的路线、与渗透性和含量反應涉及到的模试，以预侧用策略和影响。利用毒素推热力学结构型号，从转录本的含量-反應或渗透压-反應型号断定的终点外压在涉及到的人體组织含量，以便与“真实感生存”的人體组织显示确定相对比较。源自转录组学和多种组学数剧源的数剧也还可以梳理以激发其共同需求（图1）。

图1. 能够 化学品染色体组学庇护我们人类建康（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

01、发现了制度化和分折的危险

经由和手机网络定性分析是实现小型转录组动态参数集和确定好毒理学缘由和暗藏安全引响的强平台。因此，转录组影响(也许是融入性的，也也许是有不良影响的的)与充裕察到的渗透性結果间的简化认识给解释清楚给我们了挑战性。从而克服害怕这上限，造成了預测毒理学，在这其中策略配比的方式用途于新的(帮忙实现的)和目前拥有的动态参数库，以发展转录组生物学圆形标示物，这圆形标示物具备主矛盾的特殊性、能力和可多次相对偏差，将氧分子影响与毒理学目的策略和害处认识起來(图2)，特意能够搞定工业和区域环境中短缺切实毒理学动态参数的上千人种元素，并凸显了非动植物校正装置的越来越用途。 图2体现的是完成传统基本模式符合、转录组微动物学技术工程标志图案图片图案图案物和加权平均法平均表观遗传共体现介绍予测毒副意义的产品流程图。1将動物或体体细胞爆出于不有需提交动物学技术学上类目毒副意义结果显示(但应该具微动物学技术工程活性氧)的扮演毒素和动物学技术学上品中，保持转录组谱基准数剧库（图2a）。完成传统基本模式符合，可体现每一个扮演毒素中最调整和降低表观遗传的对接性图谱转录波动的中等级次序(图2b)。将机械设备学习知识应运软件于基准数剧，以截取予测此种型毒副意义成功率的转录组微动物学技术工程标志图案图片图案图案物，这个转录组微动物学技术工程标志图案图片图案图案物涉及一系例主要表现出体现波动的表观遗传，可以选择于予测意义和风险的毒理学考核策略（图2c）。虽然，加权平均法平均表观遗传共体现无线网络（WGCNA）从超大型数剧集中化辨识出可以选择于予测动物学技术学上介导方面的问题和毒副意义考核策略的共改善表观遗传簇。关于每一个种方式 ，会完成新的检验实验英文，应运软件体体细胞或動物总计测试图片来认定新氧化物会不会介导了与基准毒素的接入图谱相符合的转录谱，会不会与转录组微动物学技术工程标志图案图片图案图案物(予测当前考核策略)相关，或者会不会靶向药物予测簇内表观遗传的体现波动。

图2. 可以通过玩法适应、转录组菌物因素物和加权平均基因遗传共表现研究分析预測毒副作用

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

02、单細胞和发展空间的化学品表观遗传组学

基本数毒素人类基因组学深入分析在线测量方法了更多结构或样板的转录谱，这的限制了这句话数量化特殊受损人体血肿瘤细胞群冒出的移动数据信号的实力。在例如整个的结构样板的更多受损人体血肿瘤细胞型号冒出的发应移动数据信号的异质性中，少见和未探究方法的受损人体血肿瘤细胞群对毒素的转录发应十分不易在线测量方法。因，单受损人体血肿瘤细胞RNA测序(scRNA-seq)和范围转录组学有机会小臭进一步加强制度化毒理学深入分析。 与大规模的结构中的RNA-seq比起，scRNA-seq校正1个高中物理分开肿瘤生殖体组织开展中的什么是染色体表示，这来说校正肿瘤生殖体组织开展对化学工业品的特男人反响至关核心。举个例子，在肺样例中，中性化粒肿瘤生殖体组织开展转录组需要在肿瘤生殖体组织开展成熟期和沾染反响阶段中引发转变 ，仅是这样的数据可能会会被大规模的RNA-seq所消弱，某些RNA-seq搅拌了其他的含有相当的不同的转录组的肿瘤生殖体组织开展结构性质，如上皮肿瘤生殖体组织开展(图3a)。在化学工业物料的曝光下，结构样例体现什么是染色体的转录程度引发转变 （图3b），但选用大规模的RNA-seq校正的什么是染色体1、什么是染色体2和什么是染色体3的什么是染色体表示转变 常见是恐惧的。相悖，单肿瘤生殖体组织开展RNA-seq以更为重要的敏锐度采集肿瘤生殖体组织开展结构性质特男人什么是染色体表示转变 （图3c-d）。 我以为在毒理学运用中还是比较迎新，但scRNA-seq和的空间转录组学已然就开始展示 有趣的英文的个人见解。

图3. 毒理学单神经元RNA测序

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

03、单组织和房间的有害物质遗传基因组学

转录组学到目前为止是化学品表观遗传组学的主要，但操作整体毒理学会采用检测的和整合资源来于多种怪物安排平均水平的信心，为化学品的导致出具格外的理念。操作整体毒理学须得“几组学”，在其中转录组学会与表观遗传组学、表观表观遗传组学、淀粉酶质组学、分解代谢组学、脂质组学和显像表型组学相融入，以恢复原状分析的办法与血细胞和安排表型涉及的碳原子优缺点。总的言之，这的办法已被多使采用分析临床试验药理学现象、重大疾病病机学和正常情况下怪物情形的重造。在毒理学的视频背景下，几组学已是被使采用临床试验广泛应用和分析环境露出的导致(图4)。

图4. 两组学在系统化毒理学中的目的

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

拜谱个人心得体会

两组学研发方案分析和的动态数据聚合步骤非常广泛利使用在临床药学药理毒理学，研发方案分析药物治疗和症状形态的生物制品反映。两组学能有助于“运动风格化毒理学”的改变，这里面ibms的的动态数据库使用在分折临床药学药理的结果。另外，生活自然周围环境曝光利用的系统的毒理学两组学愈来愈越各地使用在研发方案分析生活自然周围环境普通机械品对人類健康的的直接作用，这正当增进我国对人類曝光(即对每个人的累积到生活自然周围环境曝光和相关联直接作用)的认识自己。 软件毒理学由区别各层次感的生态学结构分解成，从组织細胞反應到生态学体水平方向反應。来自于某些区别品类生态学原子核（如染色体遗传、核膳食纤维、消化吸收物、脂质等）的数据统计作为了介绍生物学物品物品或别应激性源对生态学软件扰动的填写短信。染色体遗传组、转录组、单组织細胞转录组、核蛋白质组、消化吸收组、脂质组等软件生态学学的策略能够咱们对2个各层次感的原子核去深入分析，最中預测生物学物品品影响，合为人们的稳定隐患分析评估作为短信。

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分类期刊论文：Meier MJ, Harrill J, Johnson K, Thomas RS, Tong W, Rager JE, Yauk CL. Progress in toxicogenomics to protect human health. Nat Rev Genet. 2024 Sep 2. doi: 10.1038/s41576-024-00767-1.