
近日,上海医科高中首先附属医阮医阮王学浩院士评选精英团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向药物势能分解检测分析服务。
英文怎么说主题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕小标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客人标准:南京医科大学
探究的原材料:细胞
拜谱可以提供提供服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶向治疗消耗的能量代谢率组
高技术的路线:
理论研究最终
01、YBX1被检测为HCC中糖酵解的关键点遗传基因
本研究探讨采样HCC淋巴肺部癌症范本(n=7)的单生殖公司RNA测序数剧集来进行研究具体分享,感觉糖酵解活性氧主要集约化在淋巴肺部癌症生殖公司中,hdWGCNA研究具体分享辨认出9个遗传基因模块电源(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的荒岛求生存研究具体分享判别YBX1为自立荒岛求生存安全隐患关键因素(图1H)。进每一步融入IHC、WB实验英文和淋巴肺部癌症公司与毗邻非淋巴肺部癌症公司的室内空间转录组学数剧集证明YBX1是肝生殖公司癌中药治疗的风险靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选择为调高HCC生殖细胞糖酵解的至关重要影响
02、YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点势能分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加快HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1配合并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融合并使得YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化加强其磷碱化,可以使得其核转位
进每一步一个脚印监测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否能够的影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC受损細胞中或用OGT控剂型OSMI-1外理,YBX1核蛋清级别明显变低,YBX1磷硝化作用明显缩短(图4A-C)。IP实验所现示,在完全相同的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷硝化作用级别明显要高于YBX1-T57A,表述磷硝化作用的添加不只仅是为了更高一些的YBX1核蛋清传达(图4D)。转移了核和质多组分出现TMG外理的HCC受损細胞中YBX1核传达的偏高(图4E-F),进每一步一个脚印出现YBX1磷硝化作用的关键点调低要素是AKT(图4G-I)。等出现重视O-GlcNAc糖基化能够 使得其磷硝化作用来明显增强YBX1核蛋清维持性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有帮助于其进每一步出现磷酸性反应掩盖并可催进其核转位
05、YBX1有利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加速PKM2转录
06、YBX1 就能够上升组蛋白酶乳硝化作用绘制平均水平
钻研知道YBX1敲低同质性性走低蛋清质乳硝凝成用,需要是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解仰药制剂2-DG的研究表明了糖酵解与组蛋清乳硝凝成用的随时关系,仰制糖酵解可同质性性走低H3K18la关卡(图6D)。PKM2过表现可逆转转YBX1敲低所导致的H3K18la走低,之外源乳酸清理并不是提高H3K18la,还伴有YBX1表现上涨,显示存有正向着反映(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR表明,H3K18la利用丰度于YBX1起动子随时可以淡化其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化监测(图6H-J),并知道P300 上涨是YBX1增进H3K18乳酰凝成用的管理机制(图6K-L)。
图6.YBX1增加H3K18乳酸性反应装饰能力
软文工作小结
在一项实验中报道怎么写了YBX1在HCC中高表述,但是与糖酵解密码切涉及。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,所以相对稳定球氨基酸并多其表述。这样的体现还带动YBX1在T57处的磷过酸,带动其核易位。之所以,某种进程开展了糖酵解涉及表观遗传的转录并影响乳酸的形成。前者,YBX1系统激活P300的转录,必将带动组球蛋白质的乳过酸,特别是H3K18la,H3K18乳过酸正向着调空YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正反两面馈环策略图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向药物电量分解组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、全文翻译后突显组学、分解代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.