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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网路药理学学具体分析草酸钙肾结石防氧化应激性和感染挫伤管理机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿装置最易见的疾病症状最为。肾团队中CaOx氯化钠晶体过趋于稳定岩浆岩会导至肾小管神经细胞挤压伤和凋亡,为了导至肾结石的组成。短链乳酸酸由可以使肠胃内好氧池日常细菌酵饮食营养纤维材料生产,往往在不规则可以使肠胃第一道防线中起目的,然而在装置级别上也起根本目的。这之中,丁酸是最丰富多样的短链乳酸酸,兼有免疫力调节和免疫力调节目的,本研究探究探究丁酸对CaOx肾结石的目的举例说明风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医生泌尿内科吴忠先生、周子健搏士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网站药剂学学产品,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者政府部门:华山大医院 研究探讨喜欢的人:大鼠、HK-2細胞 分类信息内容:较组(Con)、建模组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱打造技木:wifi网络药学学查测

思维方法图

科学研究结论

论述人士首要建设方案大鼠沙盘型号,使用生理性生物化学质量指标和组识方面的问题学染色的等论述的方式发现了丁酸不错可以减少CaOx沙盘型号大鼠肾CaOx尖晶石的组成和直接拉伤,改变CaOx沙盘型号大鼠的炎症病变直接拉伤和被氧化反应物资的过于描述。不仅如此,丁酸还可限制草酸介导的HK-2神经元直接拉伤、被氧化反应应激性和神经元凋亡。 为探究性学习丁酸设备构造和靶DNA互联网,研发工人从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和3D设备构造(图1A)。可以通过PharmMapper数值库和Uniprot数值库处理后共淘汰出11七个丁酸靶DNA供进1步研究阐述。将DNA文件列表加入STRING数值库,通过PPI互联网研究阐述。Cytoscape给定了编排的前20的交通联络线靶DNA的详解互联网图,还有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这样交通联络线DNA与互联网中的其它的DNA均展示出肯定的关干于内容性,阐述这样DNA几率产生着联合目的。GO和KEGG研究阐述折射出了丁酸交通联络线DNA的关干于内容有效路径和生物工程体学模块(图1C)。交通联络线DNA核心与类固醇刺肾上腺素回复、氧化不良反应的应激性状态回复、化学上活化氧体细胞对类固醇刺肾上腺素的刺激的表现或对咸性化学上物料的表现关干。综合上面的阐明,这样交通联络线DNA核心参于了氧化不良反应的应激性状态和对化学上活化氧的生物工程体表现的过程 ,是肾结石建成新机制中至关关键性的有效路径,这反映出丁酸几率在肾结石中产生关键性目的。

图1| 丁酸构造与靶dna网路浅析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步打磨丁酸对CaOx肾结石或许切靶遗传遗传染色体,调查工作员利用率GEO数据表格资料库对GSE73680中正常比与CaOx肾结石朋友的遗传遗传染色体不同完成了调查。比组与CaOx结石朋友的涉及联系数性不同传达遗传遗传染色体(DEGs)肿瘤筛查基准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个遗传遗传染色体再次发生涉及联系数变动,在这其中3379个(89.4%)遗传遗传染色体传达调涨,404个(10.6%)遗传遗传染色体传达下跌(图2A)。对DEGs完成聚类分析介绍介绍,热图界面显示了前10个被选中DEGs的二维等级聚类分析介绍特点(图2B)。之后,调查工作员根据GeneCards数据表格资料库人造评定了370个有可能与CaOx肾结石涉及联的遗传遗传染色体,排名第一前20位的預测遗传遗传染色体举例涉及联性评分表如图是2C如图。成了看到丁酸的治疗CaOx肾结石的至关重要靶点,调查工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及联遗传遗传染色体加工能够 了了个Venn图。终结,CYP2C9被判断为丁酸应响CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。与此同时,调查工作员还完成了丁酸与CYP2C9的碳原子指导,CYP2C9的三有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互间做用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用率网上药理学学推测CYP2C9是丁酸印象CaOx肾结石的靶DNA后,科学研究师还利用肿瘤细胞核实验报告表明了CYP2C9可影响草酸介导的HK-2肿瘤细胞核的ROS质量、疾病软组织损伤和凋亡。

图2| 半数以上据库联席具体分析推测CYP2C9是丁酸能力于CaOx肾结石的靶表观遗传

探讨然而

本探讨最先察觉到丁酸在休外和人体均能缓和CaOx肾结石模式的阳极氧化反应应激反应性和发炎直接影响,其次能够网路药剂学学学淘汰赢得丁酸直接影响CaOx肾结石的风险靶点——CYP2C9,后能够内部工作断定CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2内部ROS平行、发炎直接影响和凋亡。那些察觉到反映丁酸应该能够缓和CYP2C9来缓和CaOx肾结石的阳极氧化反应应激反应性,减弱发炎直接影响。这样的过程中拜谱微怪物供应了网路药剂学学学技術服務,再者拜谱微怪物可延长心智成熟逐步完善的基因组组学、脂肪酸质组学、代谢率组学等两组学商品及技術服務,喜爱拨打咨询公司! 参看文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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