
2024年7月,安徽医科大学刘业海等团队在Molecular Cancer(IF=27.7)上发表了“A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression”的研究论文。该论文首次揭示了PFKP /c-Myc正反馈通路在HNSCC的恶性进展中发挥重要作用,同时靶向PFKP和c-Myc是一种新的HNSCC的有效治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了核蛋白互作组验测的服务,助力发现PFKP可能在HNSCC的进展过程中与ERK2相互作用,从而激活MAPK/ERK通路。
2英文文章标题:PFKP和c-Myc之间的正反馈通路促进头颈部鳞状细胞癌的进展
发布杂志期刊:Molecular Cancer
不良影响指数:27.7
刊发精力:2024年7月
笔者方:安徽医科大学
拜谱打造工艺:核蛋白互作组
技艺风格:
研究方案最后
1.PFKP与ERK2彼此功效,解锁MAPK/ERK通道
前期的qRT-PCR和免疫印迹实验结果表明PFKP在肿瘤组织中高表达,并与HNSCC患者预后不良相关,通过PFKP敲低及过表达的体内体外实验表明PFKP促进HNSCC患者的肿瘤发展。为了探究PFKP促进肿瘤发展的机制,使用PFKP敲低的细胞和对照组进行了转录组分析,共筛选出2019个差异基因,其中906个上调,1113个下调(图1A)。差异基因的KEGG富集分析发现,MAPK途径是PFKP抑制后显著改变的途径之一(图1B),ERK途径是所有MAPK信号转导途径中最重要的信号级联,在肿瘤细胞的生存和发展中起着至关重要的作用。ERK级联的激活在各种癌症类型中普遍存在,超过90%的HNSCC患者存在磷酸化的ERK1/2 (p-ERK1/2)。结果表明,细胞中PFKP的敲低导致p-ERK1/2水平降低,而PFKP的过表达导致p-ERK1/2水平升高(图1C)。通过蛋清互作组探测、IF测定、CoIP 测定证明PFKP可能在HNSCC的进展过程中与ERK2相互作用(图1D-1H),确定了PFKP和ERK2之间的结合区域位于氨基酸412-784(图1J)。通过分子对接和CoIP检测表明了PFKP与ERK2结合的特定残基为K753。这些数据表明 PFKP 可能在 HNSCC 的进展过程中与 ERK2 相互作用。
图1 PFKP在ERK2修改密码MAPK/ERK环路
2.PFKP经由激活卡ERK信号通路来怎强c-Myc蛋清的稳定的性
TCGA的GSEA数据显示,HNSCC中PFKP高表达组Myc信号所靶向的基因存在富集(图2A)。与p-ERK1/2水平一致,观察到PFKP敲低的细胞中c-Myc和p-S62-Myc水平显著降低,细胞过表达PFKP导致c-Myc和p-S62-Myc的上调(图2B)。免疫荧光实验证实了PFKP对c-Myc的正调控作用(图2C)。然而qRT-PCR结果显示,PFKP对c-Myc的调控不在mRNA转录水平(图2D-E)。研究团队通过CHX(环己酰亚胺)追踪分析检测蛋白质稳定性,与对照组相比,PFKP敲低的细胞中c-Myc的降解显著加速(图2G-H)。此外,MG132预处理可以抑制PFKP耗竭引起的c-Myc的加速降解(图2F)。泛素化定性分析证明,PFKP的异常驱动了c-Myc的泛素化和溶解,飞过展现PFKP则控制了某些方式(图2L-M)。这些发现支持以下结论:PFKP 可能与 ERK2 相互作用,通过抑制泛素介导的 c-Myc 降解而上调 c-Myc。
图2 PFKP可以淡化了ERK介导的c-Myc的稳定的性
3.c-Myc提高HNSCC中PFKP的转录
在PFKP敲低的上皮癌受损细胞中过抒发c-Myc,数据库显示信息文件文件资料表现,过抒发c-Myc终结了PFKP敲低针对上皮癌受损细胞繁衍、血管壁绘制、转入和外侵的宏观调控效应。PFKP机会凭借力促c-Myc抒发力促HNSCC新进展、生长发育和移转。方便进三步洞察具体定性分析一下c-Myc宏观调控PFKP转录的体制,凭借生物技术企业信息学、TCGA-HNSCC数据库显示信息文件文件资料及K-M能具体定性分析证明,转录分子c-Myc与PFKP呈正相关联。出自于共公数据库显示信息文件文件资料库的ChIP-seq和RNA-seq数据库显示信息文件文件资料表现,c-Myc在PFKP的重启子领域有着显移动信号,以及淋巴结瘤上皮癌受损细胞中c-Myc少后PFKP mRNA程度抒发量有效影响(图3A-F)。选择JASPAR(转录分子估计数据库显示信息文件文件资料库)估计具体定性分析,位点突变率及ChIP-qRT-PCR数据库显示信息文件文件资料揭示c-Myc 机会凭借进行凭借 PFKP 的重启子来转录上涨 PFKP(图3G-K)。抗体组化染料数据库显示信息文件文件资料表现,与PFKP相同,c-Myc在癌结构中的抒发高过其匹配的健康结构,以及PFKP和c-Myc高抒发的HNSCC患有的总能期明星更差(图3L-P)。c-Myc机会凭借凭借PFKP染色体的重启子上涨PFKP的转录,PFKP和c-Myc都机会与HNSCC的愈后光于。
图3 c-Myc有趣PFKP基因遗传的转录
4.靶向药物 PFKP 和 c-Myc 阻止 HNSCC 癌症发展
研究探讨者运用HNSCC PDO模板估评了PFKP减弱剂(PFKP siRNA)与c-Myc减弱剂(10,058-F4)携手方法的辽效。毕竟展示,PFKP和c-Myc的携手减弱比单减弱剂方法更可行地减弱HNSCC PDO的产生(图4A-H)。
图4 靶向药物 PFKP 和 c-Myc 缓和 HNSCC 肉瘤进度
散文总结ppt
本研究利用转录组、核蛋白互作组、免疫共沉淀和CAM实验等分子生物学和细胞生物学技术对前期构建的HNSCC细胞系、类器官、PDX模型及120例临床样本进行了深入研究,同时结合生信分析,发现HNSCC患者组织和细胞中PFKP表达水平明显升高,并与患者的预后呈负相关;敲低PFKP显著抑制了HNSCC的增殖、血管生成以及转移。进一步研究发现,PFKP进行搭配ERK2仰制c-Myc的泛素化分解,才能有助于HNSCC的恶劣最新动态。此外,c-Myc作为转录因子促进PFKP的转录,同时靶向PFKP和c-Myc治疗HNSCC模型取得更好的肿瘤抑制效果(图5)。
图5 PFKP和c-Myc演变成的反馈意见控制回路,有助于HNSCC增值能力、血栓添加和变更
拜谱总结ppt
本研究旨在评估和验证PFKP和c-Myc在HNSCC肿瘤与邻近正常组织中的表达模式,探讨其对HNSCC临床特征的影响,并确定PFKP和c-Myc之间的正反馈回路在HNSCC进展中的功能作用和潜在机制。拜谱动物为本研究提供了核蛋白互作组拜谱生物,拜谱生物已研发完成并建立了完善成熟的转录组学、球蛋清组学、修饰语球蛋清组学、分解代谢组学以及几组学联和设备技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
基准文献资料: Liu W, Ding Z, Tao Y, Liu S, Jiang M, Yi F, Wang Z, Han Y, Zong H, Li D, Zhu Y, Xie Z, Sang S, Chen X, Miao M, Chen X, Lin W, Zhao Y, Zheng G, Zafereo M, Li G, Wu J, Zha X, Liu Y. A positive feedback loop between PFKP and c-Myc drives head and neck squamous cell carcinoma progression. Mol Cancer. 2024 Jul 9;23(1):141. doi: 10.1186/s12943-024-02051-6. PMID: 38982480; PMCID: PMC11232239